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头孢曲松钠 : 1 g，静脉内给药，每日一次
更多或
环丙沙星 : 200-400 mg，静脉给药，每 12 小时一次
或
氧氟沙星 : 200-400 mg，静脉给药，每 12 小时一次
或
氨苄西林 : 2 g，静脉注射，每 4 小时一次
和
庆大霉素 : 3-5 mg/kg/日，静脉给药
或
氨苄西林/舒巴坦 : 3 g，静脉给药，每 6 小时一次
更多或
庆大霉素 : 3-5 mg/kg/日，静脉给药
左氧氟沙星 : 250~500 mg，静脉内给药，每日一次
或
哌拉西林/他唑巴坦 : 3.375 g，静脉给药，每 6-8 小时一次
更多或
亚胺培南/西司他丁 : 250-500 mg，静脉给药，每 6-8 小时一次
更多或
头孢他啶/阿维巴坦 : 2.5 g，静脉给药，每 8 小时一次
更多住院治疗指征包括：无法维持口服补液或依从给药方案；患者出现发热＞39.0ºC (102.2ºF)、白细胞计数高、低血压、呕吐、脱水或脓毒症；明显体弱或由多种共病的重症患者；以及诊断不确定。有严重疾病风险的老年和免疫受损患者通常需要住院治疗。必须适当处理泌尿系统异常或潜在的复杂性因素。
相对血清或尿液中的药物浓度水平，肾髓质中较高的药物浓度有更好的疗效，所以肾组织内高浓度的药物（例如，氨基糖苷类和喹诺酮类）可能优于 β-内酰胺类抗生素。[48] 对于患有潜在结构性或功能性泌尿系疾病的复杂性肾盂肾炎患者，由于可能对氟喹诺酮类具有高度耐药性，因此氟喹诺酮类并不自主适用于此类患者的经验性抗微生物药物治疗。[46]
社区尿路病原体的药物敏感性也将指导治疗决策。
庆大霉素为 FDA 妊娠 D 类药物。只有在治疗的益处大于风险时，才可以在妊娠女性中使用。使用这种药物的相关风险主要是肾毒性和耳毒性。因为有数据支持，许多专家支持在妊娠期使用这种药物，但要剂量适当和监测血清波谷水平。[54][60][61] 然而有病例报道说，在妊娠期间使用庆大霉素与胎儿毒性相关，所以建议谨慎使用。
疗程是 2 周。
头孢克肟 : 400 mg，口服，每日一次，连服 2 周
更多或
环丙沙星 : 500 mg，口服，每日两次，连服 1~2 周
或
氧氟沙星 : 200~300 mg，口服，每日两次，连服 1~2 周
左氧氟沙星 : 250~500 mg，口服，每日一次，连服 1~2 周
或
甲氧苄啶/磺胺甲噁唑 : 160/800 mg，口服，每日两次，连服 2 周
更多或
阿莫西林/克拉维酸 : 875 mg，口服，每日两次，连服 2 周；或者 500 mg，口服，每日3次，连服 2 周
更多如果服用抗生素，应根据当地药敏培养结果选择抗生素。
大多数单纯性病例可以治愈，而且没有后遗症。
建议将氟喹诺酮和头孢菌素类用于非复杂性肾盂肾炎口服治疗。或者，如果已知微生物是敏感的，可使用甲氧苄啶/磺胺甲噁唑或口服 β-内酰胺类治疗轻度病例。[30][46]
头孢曲松钠 : 1 g，静脉内给药，每日一次
更多或
环丙沙星 : 400 mg，静脉给予，每 12 小时一次
或
氧氟沙星 : 200-400 mg，静脉给药，每 12 小时一次
或
氨苄西林 : 2 g，静脉注射，每 4 小时一次
和
庆大霉素 : 3-5 mg/kg/日，静脉给药
或
氨苄西林/舒巴坦 : 3 g，静脉给药，每 6 小时一次
更多或
庆大霉素 : 3-5 mg/kg/日，静脉给药
左氧氟沙星 : 250~500 mg，静脉内给药，每日一次
或
哌拉西林/他唑巴坦 : 3.375 g，静脉给药，每 6-8 小时一次
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亚胺培南/西司他丁 : 250-500 mg，静脉给药，每 6-8 小时一次
更多或
头孢他啶/阿维巴坦 : 2.5 g，静脉给药，每 8 小时一次
更多应根据局部耐药性数据选择抗生素药物，并应根据敏感性结果确定治疗方案。[30][46]
住院患者应该在48 ~ 72h内出现改善；如果没有，则考虑重复培养和/或影像学检查以评估其他潜在感染性病因或进行解剖或功能性生殖泌尿病理治疗干预。
治疗的持续时间应根据患者对治疗的反应进行调整。
如果是革兰阳性球菌致病，使用氨苄西林-舒巴坦治疗或可加上氨基糖苷。[30]
随着病情改善，患者的治疗方案可改为微生物对之敏感的口服抗微生物药物，完成治疗过程。[30]
庆大霉素为 FDA 妊娠 D 类药物。只有在治疗的益处大于风险时，才可以在妊娠女性中使用。使用这种药物的相关风险主要是肾毒性和耳毒性。因为有数据支持，许多专家支持在妊娠期使用这种药物，但要剂量适当和监测血清波谷水平。[54][60][61] 然而有病例报道说，在妊娠期间使用庆大霉素与胎儿毒性相关，所以建议谨慎使用。
疗程是 2 周。
头孢克肟 : 400 mg，口服，每日一次，连服 2 周
更多或
环丙沙星 : 500 mg，口服，每日两次，连服 1~2 周
或
氧氟沙星 : 200~300 mg，口服，每日两次，连服 1~2 周
左氧氟沙星 : 250~500 mg，口服，每日一次，连服 1~2 周
或
甲氧苄啶/磺胺甲噁唑 : 160/800 mg，口服，每日两次，连服 2 周
更多或
阿莫西林/克拉维酸 : 875 mg，口服，每日两次，连服 2 周；或者 500 mg，口服，每日3次，连服 2 周
更多需要重复进行尿培养和抗微生物药敏试验。重复培养时，若菌株和药敏试验结果是相同的，应进行肾脏超声或 CT 扫描。
治疗可以采用初步治疗所用相同抗生素的更长疗程治疗，或者根据尿培养和敏感性结果使用不同的抗生素治疗。
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