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金黄色葡萄球菌或链球菌疖病的病变通常是疼痛的，而皮肤炭疽病变则是无痛的。 细菌性疖病也可能出现反复的发烧，淋巴炎和化脓性引流。[2]
在患细菌性疖病时，伤口标本革兰染色和培养应能显示典型的病原体，例如葡萄球菌或者链球菌。
患者会出现中性粒细胞减少。
血或组织培养将显示与坏疽性脓疱相关的典型病原体，例如铜绿假单胞菌、葡萄球菌和念珠菌。
在ORF的情况下，结痂，但不存在皮肤炭疽的特征性焦痂。 此外，与炭疽相关联的明显水肿也不会发生。 ORF病例通过临床和与受感染的绵羊或山羊肉的接触史鉴别。
ORF的组织学检查显示表皮增生，坏死，假血管瘤样增生和真皮嗜酸性粒细胞为主的浸润。[56]
棕色隐遁蛛咬伤伴有疼痛，而皮肤炭疽的病变通常无痛。此外，与炭疽相关联的明显水肿也不会发生。棕色隐遁蛛咬伤病例发生在流行地区。棕色隐遁蛛（平甲蛛属）见于美国内布拉斯加州东南部、堪萨斯州、俄克拉荷马州、得克萨斯州、路易斯安那州、阿肯色州、密苏里州、肯塔基州、田纳西州、密西西比州、阿拉巴马州、佐治亚州北部和俄亥俄州南部部分地区、印第安纳州、伊利诺伊州、爱荷华州。[57]
血液或伤口培养不会发现炭疽杆菌。
吸入性炭疽早期的不适感、疲乏、低热和呼吸困难症状可能类似于流感。然而，炭疽病例不会发生鼻炎、咽炎和鼻塞。[58]
炭疽热病例可能从胸片存在纵隔增宽与流感区分开来。 快速抗原检测和口咽病毒培养如果呈流感阳性可能是有用的。
肺炎和吸入性炭疽均可表现出咳嗽和发热；但是，依据意识丧失、头晕、意识模糊、恶心、呕吐和呼吸短促等其他症状可鉴别出炭疽。
血培养不会发现炭疽杆菌。
恢复期血清的支原体特异性 Ig 滴度升高。
鼻咽分泌物，痰液或咽拭子分子诊断阳性。
病毒性肺炎与吸入性炭疽均可表现出咳嗽和发热；但是，依据意识丧失、头晕、意识模糊、恶心、呕吐和呼吸短促等其他症状可鉴别出炭疽。此外，病毒性肺炎患者可能表现出咽痛和流涕，而炭疽杆菌患者无这些表现。
血培养不会发现炭疽杆菌。
在有心血管疾病、高胆固醇和高血压病史的情况下，可能发生主动脉动脉瘤破裂继发心血管衰竭，而吸入性炭疽患者可能无这些病史。
X光显示纵隔增宽很像主动脉瘤破裂;不过，炭疽的纵隔变化发生在感染早期肺水肿的时候。
这两种疾病均可有恶心和呕吐；但是，摄入性炭疽往往有腹部反跳痛、腹水、口咽黏膜溃疡或假膜形成。[43]
血液、腹水或口咽分泌物培养不会发现炭疽杆菌。应将标准血液培养送至实验室检查。进一步确证试验（免疫组化染色、γ 噬菌体、PCR 检测）在美国必须由实验室响应网络 (Laboratory Response Network) 站点中的参考实验室站点实施，在其他国家根据当地规定完成。[34]
牛痘病变的特征是形成水疱，发展为类似焦痂的结痂，可在人与奶牛乳房上的牛痘溃疡直接接触时发生。 病例通过历史线索和受影响的动物接触加以区分。
无可用于鉴别的检查。
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